James Siqueira Pereira

About

Bacharel e Licenciado Pleno em Ciências Biológicas (UFRA - 2013-2017; UNIUBE 2022-2023). Mestre em Biotecnologia Aplicada à Agropecuária pela Universidade Federal Rural da Amazônia - UFRA (2019-2021). Doutorando em Bioinformática pela Universidade de São Paulo - USP/ Instituto Butantan (2023 - Em andamento). Tem experiência na área de Genética, com ênfase em Bioinformática, atuando principalmente nos seguintes temas: Modelagem Computacional de Proteínas, Genômica Comparativa e Subtrativa e Vacinologia Reversa.

Employment

• Instituto Butantan PhD Candidate
  2023 - Present

Education

• Universidade de São Paulo Doutorando
  2023 - 2027
• Universidade de Uberaba Licenciatura em Ciências Biológicas
  2022 - 2023
• Universidade Federal Rural da Amazônia Mestre em Biotecnologia Aplicada a Agropecuária
  2019 - 2021
• Universidade Federal Rural da Amazônia Bacharel em Ciências Biológicas
  2013 - 2017

Projects & Funding

Projects & funding information is unavailable.

Publications (10)

• Phylodynamic reconstruction of H1N1pdm09 influenza virus transmission in Brazil: a decade of evolutionary dynamics
  Emerging Microbes & Infections 2026 DOI: 10.1080/22221751.2026.2620237
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• Enterovirus D68 Subgenotype B3 Circulation in Children with Acute Respiratory Illness in the State of Alagoas, Brazil
  Viruses 2025 DOI: 10.3390/v17020242
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• Unraveling Dengue Serotype 3 Transmission in Brazil: Evidence for Multiple Introductions of the 3III_B.3.2 Lineage
  2025 DOI: 10.1101/2025.01.23.634513
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• Unravelling dengue serotype 3 transmission in Brazil: evidence for multiple introductions of the 3III_B.3.2 lineage
  Virus Evolution 2025 DOI: 10.1093/ve/veaf034
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• Comprehensive molecular epidemiology of influenza viruses in Brazil: insights from a nationwide analysis
  Virus Evolution 2025 DOI: 10.1093/VE/VEAE102
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• Reassessing the dengue virus type 4 in Brazil: Genomic sequencing and dispersion dynamics, 2011-2017
  Infection, Genetics and Evolution 2025 DOI: 10.1016/J.MEEGID.2025.105731
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• Comprehensive Molecular Epidemiology of Influenza Viruses in Brazil: Insights from a Nationwide Analysis
  2024 DOI: 10.1101/2024.07.04.602044
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• A new lineage nomenclature to aid genomic surveillance of dengue virus
  PLoS Biology 2024 DOI: 10.1371/JOURNAL.PBIO.3002834
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• Proposing a Systematic Lineage Classification Below the Genotype Level for Dengue Serotypes 1 and 2
  BioRxiv 2024 DOI: 10.1101/2024.03.25.586629
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• Insights Into Limnothrix sp Metabolism Based on Comparative Genomics
  Frontiers in Microbiology 2018 DOI: 10.3389/FMICB.2018.02811
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